特朗普下令美军空袭伊朗三个关键核设施，此举固然可能破坏了伊朗已知的核能力，但对于未来甄别伊朗剩余核设施的数量和位置带来巨大挑战。
特朗普称，周六晚间被重兵防护的核设施已“完全摧毁”，但独立分析尚未证实这一说法。三位关注伊朗核计划的消息人士表示，空袭并未带来快速胜利，反而加大了追踪铀材料和防止伊朗制造核武的难度。
国际原子能组织（IAEA）监督员仍驻留伊朗，以色列6月13日开始轰炸伊朗的前一天，IAEA正在该国检查多个核设施。现在他们还在评估核设施损害程度。虽然军事行动可能摧毁伊朗申报的设施，但也会促使这个伊斯兰国家将更多核项目转入地下。
特朗普派出携带GBU-57重型穿甲炸弹的B-2隐形轰炸机，试图摧毁位于纳坦兹和福尔多的地下铀浓缩设施。周日，Maxar Technologies发布的福尔多卫星图显示新出现的弹坑、可能坍塌的隧道入口和山脊上的洞穴，但福尔多的一个大型支撑建筑未受损，该建筑可能用于控制地下铀浓缩通道的通风。
国际原子能组织报告称未发现辐射泄漏。美国空军将军Dan Caine周日在新闻发布会上表示，“进行最终战损评估还需一定时间”。
与此同时，IAEA核查员已超过一周未能确认伊朗近武器级铀储存位置。伊朗官员承认他们拆除了IAEA封条并将材料转移至未公开地点。密苏里州怀特曼空军基地英国智库Royal United Services Institute的高级研究员Darya Dolzikova认为，美国参战不太可能促使伊朗加强与IAEA合作。
她说：“更可能的情况是，伊朗从此认为保持合作和透明度没有用，他们转而会把核设施放在更深更隐秘的位置以避免未来被攻击。”
IAEA总干事Rafael Mariano Grossi表示，35国组成的理事会将于周一在维也纳召开会议，呼吁停止敌对行为。
美国介入前，卫星图像显示以色列单独发动轰炸的四天效果有限，纳坦兹中心设施受损的主要是电力开关场和变压器。
美国还参与攻击了伊斯法罕核技术研究中心（距德黑兰450公里），此次攻击是在IAEA重新评估以色列对该设施造成的损害程度后进行的。该组织在周六晚间表示，根据卫星图像和与伊朗方面的沟通，伊斯法罕设施“遭受了广泛的破坏”。IAEA主要任务是对核材料核查，确保不用于制造核武。前IAEA核检查政策主管iq Rauf称，此次轰炸进一步加剧了追踪伊朗铀的难度。
他说：“IAEA现在很难对近9000公斤铀材料进行核算，尤其是约410公斤的60%浓缩铀。”
上周，核查员承认由于以色列持续攻击，已失去对伊朗高浓缩铀库存的定位。
IAEA核查员在伊斯法罕见过这批铀材料，足够制造约10枚核弹，他们的体积可容纳于16个小容器内，可能已被转移。6月22日，美国袭击后福尔多核设施遭到破坏。军事分析师仍在等待新卫星图像以判断美军的作战成果，核监管专家则认为核查难度将大幅增加。
前IAEA核查主任Robert Kelley称，美以轰炸不仅扰乱了IAEA对伊朗核库存的核算，还削弱了核查员可用的工具。